La mezquita fue encargada por el sultán Sheikh Zayed bin Sultan Al Nahyan, anterior presidente de los Emiratos Árabes Unidos. Deseaba crear una mezquita capaz de aunar la diversidad cultural de distintos países del mundo islámico con nuevos valores de la arquitectura y el arte. La obra se encargó al arquitecto Yusef Abdelki. Se empezó a construir en 1996 y se terminó en el 2007.